Šiame pastate, pastatytame 1972-12-09d., veikė Z. Angariečio vidurinė mokykla. Vėliau, 1990m.Šakiuose pastačius dar vieną mokyklą, ji buvo vadinama I-ąja vidurine mokykla ,o nuo 1993m. – „Žiburio“ vidurine mokykla.
1995m. atkuriamos gimnazijos klasės „Žiburio“ vidurinėje mokykloje. Mokyklai vadovavo J.Mozūraitienė.
1998m. atkūrus Šakių mieste „Žiburio“ gimnaziją , gimnazijinės klasės palieka mūsų mokyklą.
Nuo 1998m. rugsėjo pirmosios dienos jai pradeda vadovauti R.Kučiauskas.
2002m. Šakių I-oji vidurinė mokykla pertvarkoma į pagrindinę mokyklą, tais pačiais metais , Spalio 8d. suteikiamas „Aukuro“ pagrindinės mokyklos vardas.
2009/2010 m.m.mokykloje mokosi 483 mokiniai.